Nella vicenda culturale e professionale di Bottoni l’area bolognese occupa un posto di assoluto rilievo. Nel capoluogo emiliano, più che in altri contesti, Piero Bottoni ha la possibilità di mettere organicamente alla prova l’armamentario concettuale e operativo cresciuto nella frequentazione dei Ciam; ma ha anche la possibilità di misurarsi con le implicazioni sociali della prassi urbanistica e di sperimentare personali interpretazioni del progetto urbano. Nessuno dei progetti urbanistici giungerà a realizzazione. Migliore fortuna sulla scena bolognese ha avuto il Bottoni architetto: A Bologna e a Imola egli tocca anzi alcuni dei punti più alti della sua vicenda di architetto.
Villa Muggia nel podere Bel Poggio a Imola, 1936-38, progettata con Mario Pucci, oggi ridotta a una rovina, è un capolavoro dell’architettura del novecento.
Il Circolo ippico in via Siepelunga a Bologna, 1937-40, distrutto dai bombardamenti negli ultimi mesi del 1944, è un’opera d’eccezione nel panorama del Razionalismo italiano.
Il Monumento ossario dei partigiani alla Certosa di Bologna, 1954-59, opera che fonde scultura e architettura in un canto civile, ha ricevuto il premio In-arch per l’Emilia Romagna 1961.