La chiesa fu edificata a partire dal 1554 su iniziativa del marinaio Bernardino Belladonna, la Chiesa di Santa Maria di Portosalvo ha una storia legata a un profondo atto di devozione. Belladonna, sopravvissuto a un nubifragio al largo delle coste di Napoli, volle erigere questo luogo di culto in segno di gratitudine verso la Vergine Maria, alla quale attribuiva il suo salvataggio.