Il museo, creato nel 2023, è stato inaugurato il 2 novembre dal sindaco di Madrid ed ex alunno di Comillas, José Luis Martínez-Almeida.
La missione del museo è quella di commemorare e mettere in evidenza l’identità, i valori e la tradizione educativa e formativa dell’Università Pontificia Comillas.
Il museo, che accoglie mostre ed esposizioni di artisti, si trova nella tribuna dell’ala est della Chiesa dell’Inmaculada Concepción e di San Pedro Claver (primo piano) dell’Università Comillas.